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正置荧光显微镜和普通显微镜在多个方面存在显着的区别：

光源和照明方式：普通显微镜通常使用自然光作为光源，而正置荧光显微镜则使用特定波长的紫外光作为激发光源。正置荧光显微镜的照明方式一般为落射式，即光源通过物镜直接投射在样品上，这种照明方式有助于增强样品的荧光效果。

滤镜系统：正置荧光显微镜配备了一套特殊的滤镜系统，包括激发滤光片、发射滤光片和二向色镜。这些滤镜能够滤除不需要的光线，只允许特定波长的光线通过，从而增强荧光信号的强度和对比度。而普通显微镜则没有这样的滤镜系统。

观察方式：正置荧光显微镜利用特定波长的光激发样品中的荧光物质，通过物镜和目镜系统放大观察荧光图像。这种观察方式使得荧光显微镜能够观察到普通光学显微镜无法观察到的生物样品的内部结构。

应用范围：正置荧光显微镜主要用于观察和研究生物样品中的荧光标记物或自发荧光的物质，广泛应用于生物学、医学和生物技术等领域。而普通显微镜则更多地用于观察和研究非荧光物质的形态和结构。

综上所述，正置荧光显微镜和普通显微镜在光源、照明方式、滤镜系统、观察方式以及应用范围等方面存在明显的区别。这些区别使得正置荧光显微镜在生物荧光观察和研究中具有很好的优势。